Il n'y a pas de question bête
L'association où je travaille a été contrôlé récemment. On lui a juste demandé les journaux des comptes de classe 6 (soit les dépenses).
En cas de contrôle, je ne pense pas qu'ils vérifient les contreparties (imagine que tu aies 100 clients, le travail serait titanesque).
Il vont juste s'assurer que ce que tu as facturé et déclaré correspond à ce que tu as encaissé et payé.
Effectivement, il faut conserver toutes les factures et parfois sur plusieurs années. Il est possible d'archiver les documents en PDF (non modifiables) pour que cela prenne moins de place.
Je n'ai pas encore commencé en tant qu'auto-entrepreneur, j'attends janvier ^^
Du coup j'explique surtout par rapport à mes expériences en tant que salariée.